Приказом главнокомандующего ВСЮР N 2752 от 31 декабря 1919 г. кубанские корпуса были сведены в Кубанскую армию, сформирован штаб армии. Командующим был назначен командир 3 конного корпуса генерал-лейтенант Шкуро.
В состав армии были включены все войсковые части, управления и учреждения расформированной Кавказской армии, а штаб последней обращен на укомплектование штаба Кубанской армии (приказ главнокомандующего ВСЮР N 2796 от 29 января 1920 г.).
Войска Кубанской армии на Кавказском побережье были сведены в Кубанский корпус под командованием генерал-майора Морозова (приказ Главкома ВСЮР N 2986 от 9 апреля 1920 г.), части которого отступили к границам Грузии и в начале мая 1920 г. частично сдались Красной Армии, частично - ушли в Крым и Грузию. С 1 мая 1920 г. штаб Кубанской армии был расформирован (приказ главнокомандующего ВСЮР N 3143 от 7 мая 1920 г.).
Организованные из остатков белых войск и местного населения на территории Кубани повстанческие отряды летом 1921 г. объединились в Кубанскую повстанческую армию, командующим которой приказом Кубанского повстанческого правительства N 58 от 2 июля 1921 г. был назначен генерал-лейтенант А. М. Марченко.
Войска армии включали 1 Закубанский корпус в составе 1 Закубанской (1 Запорожский и 1 линейный кп) и 2 Закубанской (1 Екатеринодарский и 1 Лабинский кп) кбр, ряда отдельных частей. Штаб армии и корпуса возглавил полковник Алексеев (приказ по армии N 1 от 8 июля).
Осенью 1922 г. части армии были разбиты красными войсками и прекратили свое существование.
